Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms