Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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