Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms