Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM83CQ9BQN1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM83CQ9BQN1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms