Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms