Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms