Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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