Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms