Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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