Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms