Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms