Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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