Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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