Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms