Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM12Q96EX1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms