Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFHD2Q96C19 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms