Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms