Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4DQ92854 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms