Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDAQ92838 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms