Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCSTNQ92542 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms