Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms