Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms