Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMER3Q8N944 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMER3Q8N944 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMER3Q8N944 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms