Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms