Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P3H3Q8IVL6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms