Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP4Q86YS3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms