Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECW1Q76N89 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms