Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC80Q76M96 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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