Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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