Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms