Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms