Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms