Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms