Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms