Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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