Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms