Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CTF1Q16619 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CTF1Q16619 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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