Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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ZNF239Q16600 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms