Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CNGA3Q16281 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CNGA3Q16281 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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