Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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