Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms