Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms