Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms