Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIX1Q15475 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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