Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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