Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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IRF4Q15306 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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