Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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