Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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