Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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