Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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